Το ζήτημα του διαχωρισμού Κράτους – Εκκλησίας με αναθεώρηση του Συντάγματος επανέφερε ο πρώην υπουργός Παιδείας, Νίκος Φίλης, τασσόμενος υπέρ της αλλαγής αυτής, επισημαίνοντας παράλληλα ότι «δεν πρέπει να γίνει πογκρόμ αλλά να είναι διακριτοί οι ρόλοι».
Ο κ. Φίλης σχολιάζοντας σε τηλεοπτική εκπομπή την απόφαση του Συμβουλίου για το μάθημα των Θρησκευτικών, δήλωσε ότι «η απόφαση του ΣτΕ είναι εκτός Συντάγματος, το σχολείο δεν είναι κατηχητικό», υποστηρίζοντας ότι εκπαιδευτικοί και μαθητές έχουν αγκαλιάσει το νέο μάθημα θρησκευτικών.
Ο πρώην υπουργός Παιδείας ανέφερε χαρακτηριστικά: «Είναι δυνατόν το Σύνταγμά μας να έχει αναφορά στην Αγία Τριάδα στην επικεφαλίδα του; Αυτό είναι υποβιβασμός και της έννοιας του Συντάγματος και της Αγίας Τριάδας, είναι κατάλοιπο άλλης εποχής που γινόταν αναφορά στο Βασιλέα».
Κληθείς να σχολιάσει τα όσα είχαν συμβεί και οδήγησαν στην αποπομπή του από τη θέση του υπουργού Παιδείας, ο κ. Φίλης είπε ότι τότε «ο πρωθυπουργός έκανε την επιλογή του που υπαγόρευσε δημοσίως ο Αρχιεπίσκοπος. Η κυβέρνηση ήθελε τότε μια ηρεμία σε σχέση με την Εκκλησία. Ήταν επιλογή απάντησης στην επιθετικότητα της κυβέρνησης. Σε άλλες περιπτώσεις έχουμε το άλλοθι της Τρόικας, δεν μπορούμε να έχουμε το άλλοθι του Ιερώνυμου στην Ελλάδα».